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Title: Phylogeny and taxonomy of meristematic rock-inhabiting blackfungi in the Dothideomycetes based on multi-locus phylogenies
Other Titles: Filogenesi e tassonomia dei funghi neri meristematici abitanti delle rocce nei Dothideomycetes basata su filogenesi multi locus
Authors: Egidi, Eleonora
Keywords: Black yeasts;Capnodiales;Meristematic fungi;Microcolonial fungi;Phylogeny;Taxonomy;Lieviti neri;Funghi meristematici;Funghi microcoloniali;Filogenesi;Tassonomia;BIO/02
Issue Date: 16-May-2014
Publisher: Università degli studi della Tuscia - Viterbo
Series/Report no.: Tesi di dottorato di ricerca. 26. ciclo
Abstract: 
The last decade has revealed an unexpected diversity of fungi associated with natural rocks, often collected in environments influenced by harsh climatic conditions. Yet the phylogenetic affiliations and the taxonomy of many of these extreme fungi, mainly belonging to Dothideomycetes, the largest class of Ascomycota, have been only partially assessed. In the present study it has been confirmed that most rock inhabiting-fungi (RIF) are highly polyphyletic among Dothideomycetidae, placed mainly within the Capnodiales, an order otherwise incorporating several families of fungi with a prominent role in plant disease. Novel taxa were identified within the two major and distinct clades of Teratosphaeriaceae, both comprising meristematic black fungi. Thirty-one novel species and thirteen new genera are proposed, based on ITS and partial nucLSU, RPB2 and BT2 sequences. Ecological preferences and evolutionary pathways of RIF from cold environments are also investigated.

Durante l’ultimo decennio è stata messa in luce una straordinaria biodiversità relativa a funghi associati a rocce naturali, spesso provenienti da ambienti influenzati da condizioni climatiche proibitive. Tuttavia i rapporti filogenetici e la tassonomia di questi funghi da ambienti estremi, appartenenti principalmente ai Dothideomycetes, la classe più ampia degli Ascomycota, sono stati solo parzialmente chiariti. In questo studio viene confermato che la maggior parte dei funghi abitanti delle rocce (RIF) sono altamente polifiletici tra i Dothideomycetidae, principalmente tra i Capnodilaes, un ordine che include numerose famiglie di funghi con un ruolo prominente circa malattie di piante. Sono stati identificati nuovi taxa all’interno dei due cladi principali e separati di Teratosphaericeae, i quali includono entrambi funghi neri. Sono stati proposti trentuno specie nuove e tredici nuovi generi, basati sulle sequenze parziali di ITS, nucLSU, RPB2 e BT2. Sono inoltre indagate preferenze ecologiche e evolutive di RIF da ambienti freddi.
Description: 
Dottorato di ricerca in Evoluzione biologica e biochimica
URI: http://hdl.handle.net/2067/2853
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