Fagus sylvatica (L.) fungal communities biodiversity and climate change – a risk analysis
Author(s)
Fontenla, Alessandra
Date Issued
May 10, 2012
Type
Doctoral Thesis
Abstract
The latitudinal and altitudinal influences on the diversity and abundance of phyllosphere (leaves and twigs) fungal community of European beech (Fagus sylvatica L.) were investigated with culture-dependent method and 454 sequencing. Ninety healthy trees and 10 declining trees distributed in two altitudinal gradients and one latitudinal gradient resulted in a total of ca. 4,000 colonies (clustered in 97 OTUs) and 170.000 ITS rDNA sequences (grouped in 895 MOTUs). Community richness was explored completely in 454 sequencing, resulting ca. 10-fold higher in respect with that detected with culture-dependent method. The abundance of several species (Apiognomonia errabunda, Biscogniauxia nummularia and Epicoccum nigrum) and taxonomic groups (Pleosporales, Capnodiales, Helotiales) were found to be related with altitude and latitude. Fungal assemblages composition resulted scarcely comparable between the two techniques.
L’influenza della altitudine e latitudine su diversità e abbondanza della comunità fungina della fillosfera (rami e foglie) del faggio (Fagus sylvatica L.) è stata valutata mediante l’utilizzo isolamenti su terreno di coltura e 454 sequencing (pirosequenziamento). Da novanta alberi di faggio sani e 10 deperienti distribuiti su due gradienti abitudinali e uno altitudinale sono state isolate in totale ca. 4.000 colonie (raggruppate in 97 OTU) e 170.000 sequenze della regione ITS dell’rDNA (raggruppate in 895 MOTU). Il 454 sequencing ha permesso di apprezzare totalmente la ricchezza della comunità fungina risultata ca. 10 volte superiore rispetto quella rilevata mediante gli isolamenti. L’abbondanza e distribuzione di alcune specie (Apiognomonia errabunda, Biscogniauxia nummularia e Epicoccum nigrum) e gruppi tassonomici (Pleosporales, Capnodiales, Helotiales) è risultata dipendere dall’altitudine e latitudine. La composizione della comunità rilevata con le due differenti tecniche è risultata poco confrontabile.
Additional information
Dottorato di ricerca in Protezione delle piante
File(s)![Thumbnail Image]()
Name
afontenla_tesid.pdf
Size
2.11 MB
Format
Adobe PDF
Checksum (MD5)
4df99f3b732bd56c0ab74d366dd46db5