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Title: Metodi classici e modelli a coalescente nella ricerca di "selection signatures" tramite marcature neutrali
Other Titles: Classical methods and coalescent models in the research of selection signatures by means of neutral markers
Authors: Scardigli, Stefano
Keywords: Selezione
Coalescente
Miostatina
Linkage disequilibrium
Selection
Coalescent
Myostatin gene
BIO/07
Issue Date: 15-Mar-2006
Publisher: Università degli studi della Tuscia - Viterbo
Series/Report no.: Tesi di dottorato di ricerca. 18. ciclo
Abstract: Lo scopo di questo lavoro è stato di mettere a punto un metodo per identificare regioni di DNA sotto selezione utilizzando le indicazioni raccolte tramite marcatori neutrali. Ho usato sia il metodo classico dell'indice di linkage disequilibrium di Lewontin sia l'indice di fissazione Fst. Ho paragonato questi metodi all'analisi del rescaled mutation rate ottenuta dal modello a coalescente standard. I dati ottenuti dalle su popolazioni simulate al calcolatore sono stati paragonati ai risultati d
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The aim of this work is to find a method for identifying chromosome areas under selection using information gathered from neighbor neutral markers. I used both the classical Lewontin's linkage disequilibrium index and the fixation index Fst. I compared these methods with the analysis of the rescaled mutation rate as estimated by the standard coalescent model. Data obtained from computer-simulated populations were compared with the results from the analysis of the real ones. The real data con
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Description: Corso di dottorato in Ecologia e gestione delle risorse biologiche
URI: http://hdl.handle.net/2067/83
Rights: If not otherwise stated, this document is distributed by the Tuscia University Open Archive under a Creative Commons 2.0 Attribution - Noncommercial - Noderivs License (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.0/)
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